Genomic profile and genotype-phenotype correlations in patients with non-syndromic retinitis pigmentosa in a tertiary care centre in portugal

Abstract

Introduction: Retinitis Pigmentosa (RP) is the most frequent inherited retinal dystrophy and a major cause of visual impairment and blindness worldwide. In Portugal, the genomic profile of patients with non-syndromic RP has never been reported. This study aimed to characterize the genomic landscape of Portuguese patients with non-syndromic RP and to establish possible genotype-phenotype correlations.Methods: Cross-sectional, single-centre study conducted in 50 consecutive patients (from 39 families) with a clinical diagnosis of non-syndromic-RP, followed at a tertiary care hospital in Portugal. Patients underwent genetic testing through Sanger sequencing of a suspected gene, next generation sequencing panels, whole exome sequencing (WES)-based next generation sequencing panels or WES. Results: We found disease-causing mutations in 25/39 patients (64.10%), totalizing 22 pathogenic variants identified in 10 genes. EYS, IMPG2, RPGR and RHO were the most frequently implicated genes, explaining 72% of the solved cases. Within autosomal recessive cases, EYS was the most frequently identified gene, while RPGR and RHO were the most common among X-linked and autosomal dominant cases, respectively. Conclusion: This preliminary study is the first study to characterize the genomic profile of non-syndromic RP in Portugal. Achieving strong population-based data is the first step towards better genetic and prognostic counselling as well as guidance for future therapeutic interventions.

Introdução: A retinopatia pigmentar (RP) é a distrofia hereditária da retina mais prevalente e uma das principais causas irreversíveis de comprometimento visual e cegueira em todo o mundo. Em Portugal, o perfil genético dos doentes com RP não sindrómica é ainda desconhecido. Este estudo tem como objetivos caracterizar a etiologia genética de uma série de casos de RP não sindrómica, bem como estabelecer eventuais correlações genótipo-fenótipo.Métodos: Estudo unicêntrico, transversal, que incluiu 50 doentes consecutivos (de 39 famílias) com o diagnóstico clínico de RP não sindrómica, seguidos num centro hospitalar terciário em Portugal. Todos os doentes realizaram estudo molecular, seja através de sequenciação Sanger, painéis de sequenciação de nova geração ou sequenciação do exoma completo.Resultados: Encontrámos variantes causadoras de doença (clinicamente relevantes) em 25/39 famílias (64.10%), totalizando 22 variantes causadoras de doença em 10 genes diferentes. Os genes EYS, IMPG2, RPGR e RHO foram os mais frequentemente implicados, explicando 72% dos casos resolvidos. Na RP com hereditariedade autossómica recessiva, o gene EYS foi o mais frequente, enquanto que os genes RPGR e RHO foram os mais frequentes na RP ligada ao cromossoma X e na RP autossómica dominante, respetivamente.Conclusão: Este estudo preliminar é o primeiro estudo a reportar o perfil genético de doentes portugueses com RP não sindrómica. A obtenção de dados robustos baseados em estudos populacionais é o primeiro passo para um melhor aconselhamento genético e prognóstico, bem como para uma melhor orientação para futuras intervenções terapêuticas.